ИКИ РАН имеет три совета по защите диссертаций:
Докторский совет Д 002.113.02 
Председатель совета – академик,  профессор Р.А. Сюняев
Совет принимает к защите диссертации по следующим специальностям:
     | Шифр | Специальность | Отрасль науки | 
     | 01.03.02 | астрофизика и звёздная астрономия | физико-математические науки | 
     | 01.03.04 | планетные исследования | физико-математические науки | 
Состав совета
Докторский совет Д 002.113.03:
Председатель совета - директор ИКИ РАН, академик РАН, профессор Л.М. Зеленый
Совет принимает к защите диссертации по следующим специальностям:
     | Шифр | Специальность | Отрасль науки | 
     | 01.03.03 | физика Солнца | физико-математические науки | 
     | 01.04.02 | теоретическая физика | физико-математические науки | 
Состав совета
Докторский совет Д 002.113.01:
Председатель совета – главный научный сотрудник ИКИ РАН, д.т.н., 
профессор Г.А. Аванесов
Совет принимает к защите диссертации по следующим специальностям:
     | Шифр | Специальность | Отрасль науки | 
     | 01.04.01 | приборы и методы экспериментальной физики | физико-математические и технические науки | 
 Телефон секретаря диссертационных советов (495) 333-3200
Состав совета